Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYT6

Cap2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap2Q9CYT6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50.41■■■■■ 5.66
Cap2Q9CYT6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
Cap2Q9CYT6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Cap2Q9CYT6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
Cap2Q9CYT6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
Cap2Q9CYT6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
Cap2Q9CYT6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Cap2Q9CYT6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Cap2Q9CYT6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Cap2Q9CYT6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42■■■■■ 4.31
Cap2Q9CYT6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Cap2Q9CYT6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Cap2Q9CYT6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Cap2Q9CYT6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Cap2Q9CYT6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Cap2Q9CYT6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Cap2Q9CYT6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Cap2Q9CYT6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Cap2Q9CYT6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Cap2Q9CYT6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Cap2Q9CYT6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Cap2Q9CYT6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Cap2Q9CYT6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Cap2Q9CYT6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Cap2Q9CYT6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Cap2Q9CYT6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Cap2Q9CYT6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
Cap2Q9CYT6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Cap2Q9CYT6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Cap2Q9CYT6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Cap2Q9CYT6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Cap2Q9CYT6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Cap2Q9CYT6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Cap2Q9CYT6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Cap2Q9CYT6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Cap2Q9CYT6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Cap2Q9CYT6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Cap2Q9CYT6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Cap2Q9CYT6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Cap2Q9CYT6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Cap2Q9CYT6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cap2Q9CYT6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Cap2Q9CYT6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Cap2Q9CYT6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Cap2Q9CYT6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Cap2Q9CYT6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Cap2Q9CYT6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cap2Q9CYT6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cap2Q9CYT6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Cap2Q9CYT6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Cap2Q9CYT6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Cap2Q9CYT6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Cap2Q9CYT6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cap2Q9CYT6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cap2Q9CYT6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Cap2Q9CYT6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cap2Q9CYT6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Cap2Q9CYT6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cap2Q9CYT6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Cap2Q9CYT6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Cap2Q9CYT6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cap2Q9CYT6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cap2Q9CYT6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cap2Q9CYT6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cap2Q9CYT6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cap2Q9CYT6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Cap2Q9CYT6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cap2Q9CYT6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cap2Q9CYT6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cap2Q9CYT6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cap2Q9CYT6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cap2Q9CYT6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cap2Q9CYT6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cap2Q9CYT6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cap2Q9CYT6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Cap2Q9CYT6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Cap2Q9CYT6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cap2Q9CYT6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cap2Q9CYT6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cap2Q9CYT6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cap2Q9CYT6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cap2Q9CYT6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cap2Q9CYT6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cap2Q9CYT6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cap2Q9CYT6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cap2Q9CYT6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cap2Q9CYT6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cap2Q9CYT6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cap2Q9CYT6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Cap2Q9CYT6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cap2Q9CYT6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cap2Q9CYT6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cap2Q9CYT6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cap2Q9CYT6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cap2Q9CYT6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cap2Q9CYT6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cap2Q9CYT6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cap2Q9CYT6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cap2Q9CYT6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cap2Q9CYT6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms