Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4K1

Cetn4, Centrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cetn4Q8K4K1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
Cetn4Q8K4K1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Cetn4Q8K4K1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Cetn4Q8K4K1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Cetn4Q8K4K1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Cetn4Q8K4K1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Cetn4Q8K4K1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Cetn4Q8K4K1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
Cetn4Q8K4K1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Cetn4Q8K4K1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Cetn4Q8K4K1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Cetn4Q8K4K1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Cetn4Q8K4K1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Cetn4Q8K4K1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cetn4Q8K4K1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cetn4Q8K4K1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Cetn4Q8K4K1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cetn4Q8K4K1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cetn4Q8K4K1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cetn4Q8K4K1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cetn4Q8K4K1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cetn4Q8K4K1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Cetn4Q8K4K1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Cetn4Q8K4K1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cetn4Q8K4K1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Cetn4Q8K4K1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cetn4Q8K4K1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cetn4Q8K4K1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cetn4Q8K4K1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Cetn4Q8K4K1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cetn4Q8K4K1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cetn4Q8K4K1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Cetn4Q8K4K1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cetn4Q8K4K1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cetn4Q8K4K1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Cetn4Q8K4K1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cetn4Q8K4K1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cetn4Q8K4K1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cetn4Q8K4K1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cetn4Q8K4K1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cetn4Q8K4K1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cetn4Q8K4K1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cetn4Q8K4K1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cetn4Q8K4K1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Cetn4Q8K4K1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Cetn4Q8K4K1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cetn4Q8K4K1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cetn4Q8K4K1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cetn4Q8K4K1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cetn4Q8K4K1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cetn4Q8K4K1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cetn4Q8K4K1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cetn4Q8K4K1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cetn4Q8K4K1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Cetn4Q8K4K1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cetn4Q8K4K1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cetn4Q8K4K1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cetn4Q8K4K1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cetn4Q8K4K1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Cetn4Q8K4K1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cetn4Q8K4K1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cetn4Q8K4K1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cetn4Q8K4K1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cetn4Q8K4K1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cetn4Q8K4K1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cetn4Q8K4K1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cetn4Q8K4K1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cetn4Q8K4K1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cetn4Q8K4K1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cetn4Q8K4K1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cetn4Q8K4K1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cetn4Q8K4K1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Cetn4Q8K4K1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cetn4Q8K4K1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cetn4Q8K4K1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cetn4Q8K4K1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cetn4Q8K4K1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cetn4Q8K4K1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Cetn4Q8K4K1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cetn4Q8K4K1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cetn4Q8K4K1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cetn4Q8K4K1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cetn4Q8K4K1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cetn4Q8K4K1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cetn4Q8K4K1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cetn4Q8K4K1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cetn4Q8K4K1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cetn4Q8K4K1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cetn4Q8K4K1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cetn4Q8K4K1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cetn4Q8K4K1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cetn4Q8K4K1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cetn4Q8K4K1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cetn4Q8K4K1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cetn4Q8K4K1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cetn4Q8K4K1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cetn4Q8K4K1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cetn4Q8K4K1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cetn4Q8K4K1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cetn4Q8K4K1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms