Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.09■■■■■ 5.77
ApobrQ8VBT6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
ApobrQ8VBT6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
ApobrQ8VBT6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
ApobrQ8VBT6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
ApobrQ8VBT6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
ApobrQ8VBT6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ApobrQ8VBT6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ApobrQ8VBT6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
ApobrQ8VBT6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
ApobrQ8VBT6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ApobrQ8VBT6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ApobrQ8VBT6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
ApobrQ8VBT6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ApobrQ8VBT6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ApobrQ8VBT6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ApobrQ8VBT6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ApobrQ8VBT6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
ApobrQ8VBT6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ApobrQ8VBT6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ApobrQ8VBT6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ApobrQ8VBT6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ApobrQ8VBT6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ApobrQ8VBT6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ApobrQ8VBT6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
ApobrQ8VBT6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ApobrQ8VBT6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ApobrQ8VBT6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
ApobrQ8VBT6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
ApobrQ8VBT6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ApobrQ8VBT6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ApobrQ8VBT6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ApobrQ8VBT6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
ApobrQ8VBT6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
ApobrQ8VBT6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
ApobrQ8VBT6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ApobrQ8VBT6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ApobrQ8VBT6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ApobrQ8VBT6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ApobrQ8VBT6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ApobrQ8VBT6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
ApobrQ8VBT6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ApobrQ8VBT6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ApobrQ8VBT6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ApobrQ8VBT6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
ApobrQ8VBT6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ApobrQ8VBT6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ApobrQ8VBT6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ApobrQ8VBT6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
ApobrQ8VBT6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
ApobrQ8VBT6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ApobrQ8VBT6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ApobrQ8VBT6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
ApobrQ8VBT6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ApobrQ8VBT6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
ApobrQ8VBT6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ApobrQ8VBT6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ApobrQ8VBT6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ApobrQ8VBT6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ApobrQ8VBT6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ApobrQ8VBT6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
ApobrQ8VBT6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ApobrQ8VBT6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ApobrQ8VBT6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ApobrQ8VBT6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ApobrQ8VBT6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ApobrQ8VBT6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ApobrQ8VBT6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ApobrQ8VBT6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ApobrQ8VBT6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ApobrQ8VBT6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ApobrQ8VBT6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ApobrQ8VBT6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ApobrQ8VBT6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ApobrQ8VBT6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ApobrQ8VBT6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ApobrQ8VBT6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ApobrQ8VBT6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ApobrQ8VBT6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ApobrQ8VBT6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ApobrQ8VBT6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ApobrQ8VBT6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ApobrQ8VBT6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
ApobrQ8VBT6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ApobrQ8VBT6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ApobrQ8VBT6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ApobrQ8VBT6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ApobrQ8VBT6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ApobrQ8VBT6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ApobrQ8VBT6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ApobrQ8VBT6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ApobrQ8VBT6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ApobrQ8VBT6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ApobrQ8VBT6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ApobrQ8VBT6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ApobrQ8VBT6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ApobrQ8VBT6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
ApobrQ8VBT6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ApobrQ8VBT6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ApobrQ8VBT6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms