RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C STU2P46675 888 aa3.95□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C VPS62P53285 467 aa3.95□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C YCS4Q06156 1176 aa3.95□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C RPN3P40016 523 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C SAM37P50110 327 aa3.94□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C RPP2AP05319 106 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C CDC6P09119 513 aa3.93□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C PEX13P80667 386 aa3.93□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C DNA2P38859 1522 aa3.92□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C KIP1P28742 1111 aa3.92□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C CUE2P36075 443 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C YAP6Q03935 383 aa3.92□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C HSL1P34244 1518 aa3.91□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C SQT1P35184 431 aa3.91□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C RSM26P47141 266 aa3.91□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
GCN4YEL009C KAR2P16474 682 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C YPL260WQ08977 551 aa3.9□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C HMI1Q12039 706 aa3.9□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C TRL1P09880 827 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C SRM1P21827 482 aa3.89□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data3.89□□□□□ -1.79not detected
GCN4YEL009C SNF5P18480 905 aa3.88□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C EMC1P25574 760 aa3.88□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C GTF1P53260 183 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C SIZ1Q04195 904 aa3.88□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C GPI13Q07830 1017 aa3.88□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C SPO21Q12411 609 aa3.88□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C PTC5Q12511 572 aa3.88□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C KOG1P38873 1557 aa3.88□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C PFK1P16861 987 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C APL1P27351 700 aa3.87□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C QRI1P43123 477 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C LGE1Q02796 332 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C SVS1Q12254 260 aa3.87□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C RDH54P38086 958 aa3.86□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C PLB1P39105 664 aa3.86□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C RLF2Q12495 606 aa3.86□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C GPB2P39717 880 aa3.85□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C TIM44Q01852 431 aa3.85□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C EST2Q06163 884 aa3.85□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C PEX28P38848 579 aa3.84□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C MDJ2P42834 146 aa3.84□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C MCH5Q08777 521 aa3.84□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C FRT1Q99332 602 aa3.84□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C SSN2P38931 1420 aa3.84□□□□□ -1.79
GCN4YEL009C NDJ1Q12366 352 aa3.83□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C HIR3P47171 1648 aa3.83□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C PRP40P33203 583 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C GRS1P38088 690 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C MSC2Q03455 724 aa3.82□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C NUT2Q06213 157 aa3.82□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C ATG13Q06628 738 aa3.82□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C YER158CP40095 573 aa3.81□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C SIP5P40210 489 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C GCV2P49095 1034 aa3.81□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C ULP1Q02724 621 aa3.81□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C RIB2Q12362 591 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C TAF13P11747 167 aa3.8□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C SEC23P15303 768 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C AFG2P32794 780 aa3.8□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C ALG3P38179 458 aa3.8□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C POA1P38218 177 aa3.8□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C ERP5P38819 212 aa3.8□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C MET12P46151 657 aa3.8□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C EXG2P52911 562 aa3.8□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data3.8□□□□□ -1.8 RIP-Chip
GCN4YEL009C HIS5P07172 385 aa3.79□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C GCD6P32501 712 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C UGA4P32837 571 aa3.79□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C VPS35P34110 944 aa3.79□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C YGL140CP53120 1219 aa3.79□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data3.79□□□□□ -1.8 RIP-Chip
GCN4YEL009C OMS1Q06668 471 aa3.79□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C IRC10Q08118 586 aa3.79□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C ENB1Q08299 606 aa3.79□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C ACF2Q12168 779 aa3.79□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C HEM13P11353 328 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C PEP7P32609 515 aa3.78□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C TMN2Q04562 672 aa3.78□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C YBL113CQ7M4S9 792 aa3.78□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
GCN4YEL009C SSA1P10591 642 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
GCN4YEL009C MND2P40577 368 aa3.77□□□□□ -1.81
GCN4YEL009C TPO1Q07824 586 aa3.77□□□□□ -1.81
GCN4YEL009C PHO4P07270 312 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
GCN4YEL009C EFT1P32324 842 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
GCN4YEL009C KTR4P38131 464 aa3.76□□□□□ -1.81
GCN4YEL009C DAK2P43550 591 aa3.76□□□□□ -1.81
GCN4YEL009C CHA4P43634 648 aa3.76□□□□□ -1.81
GCN4YEL009C DAL4Q04895 635 aa3.76□□□□□ -1.81
GCN4YEL009C HOF1Q05080 669 aa3.76□□□□□ -1.81
GCN4YEL009C YOL073CQ08232 322 aa3.76□□□□□ -1.81
GCN4YEL009C AFT2Q08957 416 aa3.76□□□□□ -1.81
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