RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	HOM3	P10869	527 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	RAD53	P22216	821 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MTC2	P34246	357 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HXT7	P39004	570 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	ERR3	P42222	437 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MRPS18	P42847	217 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	REH1	Q06709	432 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YOR131C	Q12486	218 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MCM10	P32354	571 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PEX6	P33760	1030 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MNN4	P36044	1178 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HXT16	P47185	567 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	NCE103	P53615	221 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	OPT2	Q06593	877 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	UGA3	P26370	528 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PEP7	P32609	515 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	ICP55	P40051	511 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	NDE1	P40215	560 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MEP3	P53390	489 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SIW14	P53965	281 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HPF1	Q05164	967 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	WTM2	Q12206	467 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MET8	P15807	274 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	AFG2	P32794	780 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	RRN3	P36070	627 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SSN3	P39073	555 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	AAD14	P42884	376 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YDR338C	Q05497	695 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MED1	Q12321	566 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SLA1	P32790	1244 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	BSD2	P38356	321 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	DUN1	P39009	513 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MPH1	P40562	993 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PMT3	P47190	753 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PEX14	P53112	341 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	ARA2	Q04212	335 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	TAF11	Q04226	346 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	CDC45	Q08032	650 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	CDC9	P04819	755 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	BAS1	P22035	811 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	CBF2	P32504	956 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	EXO5	P38289	585 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YHL008C	P38750	627 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	VPS8	P39702	1274 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	HOT1	Q03213	719 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	ARG82	P07250	355 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SRD1	P09007	221 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MLF3	P32047	452 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YKL151C	P36059	337 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	TBS1	P38114	1094 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	ACA1	P39970	489 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SIT1	P39980	628 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YIR007W	P40566	764 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	QRI7	P43122	407 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SUM1	P46676	1062 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	YPL191C	Q08930	360 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SPO16	P17122	198 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	OPI1	P21957	404 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	PBY1	P38254	753 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	MBP1	P39678	833 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	XKS1	P42826	600 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	RMD8	P43620	662 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AI2	Q0055	SKP1	P52286	194 aa		3.28	□□□□□ -1.88

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