RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.31■■■■■ 5.16
CTTN-211ENST00000527622 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.43■■■■■ 4.38
CTTN-211ENST00000527622 ABCC9O60706 1549 aa42.02■■■■■ 4.32
CTTN-211ENST00000527622 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.15■■■■■ 4.02
CTTN-211ENST00000527622 NACADO15069 1562 aa39.97■■■■□ 3.99
CTTN-211ENST00000527622 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.55■■■■□ 3.92
CTTN-211ENST00000527622 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.49■■■■□ 3.91
CTTN-211ENST00000527622 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.45■■■■□ 3.91
CTTN-211ENST00000527622 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
CTTN-211ENST00000527622 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.19■■■■□ 3.86
CTTN-211ENST00000527622 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.14■■■■□ 3.86
CTTN-211ENST00000527622 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.1■■■■□ 3.85
CTTN-211ENST00000527622 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.07■■■■□ 3.85
CTTN-211ENST00000527622 SCRIBQ14160 1630 aa38.6■■■■□ 3.77
CTTN-211ENST00000527622 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.54■■■■□ 3.76
CTTN-211ENST00000527622 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.05■■■■□ 3.68
CTTN-211ENST00000527622 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
CTTN-211ENST00000527622 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.83■■■■□ 3.65
CTTN-211ENST00000527622 SMARCA4P51532 1647 aa36.9■■■■□ 3.5
CTTN-211ENST00000527622 NCAPD3P42695 1498 aa36.88■■■■□ 3.49
CTTN-211ENST00000527622 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.82■■■■□ 3.48
CTTN-211ENST00000527622 SMARCA2P51531 1590 aa36.71■■■■□ 3.47
CTTN-211ENST00000527622 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.46
CTTN-211ENST00000527622 HMGXB3Q12766 1538 aa36.69■■■■□ 3.46
CTTN-211ENST00000527622 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.58■■■■□ 3.45
CTTN-211ENST00000527622 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.47■■■■□ 3.43
CTTN-211ENST00000527622 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
CTTN-211ENST00000527622 NESP48681 1621 aa36.23■■■■□ 3.39
CTTN-211ENST00000527622 ERCC6Q03468 1493 aa36.19■■■■□ 3.38
CTTN-211ENST00000527622 CUX2O14529 1486 aa36.14■■■■□ 3.38
CTTN-211ENST00000527622 WIZO95785 1651 aa36.07■■■■□ 3.36
CTTN-211ENST00000527622 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.02■■■■□ 3.36
CTTN-211ENST00000527622 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
CTTN-211ENST00000527622 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.85■■■■□ 3.33
CTTN-211ENST00000527622 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
CTTN-211ENST00000527622 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.72■■■■□ 3.31
CTTN-211ENST00000527622 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.71■■■■□ 3.31
CTTN-211ENST00000527622 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.7■■■■□ 3.31
CTTN-211ENST00000527622 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
CTTN-211ENST00000527622 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.45■■■■□ 3.27
CTTN-211ENST00000527622 WDR62O43379 1518 aa35.43■■■■□ 3.26
CTTN-211ENST00000527622 CFTRP13569 1480 aa35.42■■■■□ 3.26
CTTN-211ENST00000527622 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.35■■■■□ 3.25
CTTN-211ENST00000527622 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.33■■■■□ 3.25
CTTN-211ENST00000527622 PRDM2Q13029 1718 aa35.25■■■■□ 3.23
CTTN-211ENST00000527622 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.16■■■■□ 3.22
CTTN-211ENST00000527622 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
CTTN-211ENST00000527622 TOPBP1Q92547 1522 aa34.73■■■■□ 3.15
CTTN-211ENST00000527622 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.65■■■■□ 3.14
CTTN-211ENST00000527622 IFT140Q96RY7 1462 aa34.62■■■■□ 3.13
CTTN-211ENST00000527622 ABCC8Q09428 1581 aa34.59■■■■□ 3.13
CTTN-211ENST00000527622 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
CTTN-211ENST00000527622 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
CTTN-211ENST00000527622 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CTTN-211ENST00000527622 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
CTTN-211ENST00000527622 OSCARQ8IYS5 282 aa34.36■■■■□ 3.09
CTTN-211ENST00000527622 CUX1P39880 1505 aa34.26■■■■□ 3.08
CTTN-211ENST00000527622 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.25■■■■□ 3.078e-9■■■■□ 24.7
CTTN-211ENST00000527622 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.23■■■■□ 3.07
CTTN-211ENST00000527622 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.2■■■■□ 3.07
CTTN-211ENST00000527622 CHD1O14646 1710 aa34.19■■■■□ 3.06
CTTN-211ENST00000527622 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CTTN-211ENST00000527622 TRIM41Q8WV44 630 aa34.16■■■■□ 3.06
CTTN-211ENST00000527622 SOGA1O94964 1423 aa34.14■■■■□ 3.06
CTTN-211ENST00000527622 WDR97A6NE52 1622 aa34.12■■■■□ 3.05
CTTN-211ENST00000527622 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.11■■■■□ 3.05
CTTN-211ENST00000527622 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.11■■■■□ 3.05
CTTN-211ENST00000527622 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.11■■■■□ 3.05
CTTN-211ENST00000527622 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CTTN-211ENST00000527622 ARHGEF11O15085 1522 aa33.99■■■■□ 3.03
CTTN-211ENST00000527622 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.95■■■■□ 3.02
CTTN-211ENST00000527622 PBRM1Q86U86 1689 aa33.88■■■■□ 3.01
CTTN-211ENST00000527622 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
CTTN-211ENST00000527622 GRIN2BQ13224 1484 aa33.86■■■■□ 3.01
CTTN-211ENST00000527622 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.86■■■■□ 3.01
CTTN-211ENST00000527622 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.85■■■■□ 3.01
CTTN-211ENST00000527622 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.83■■■■□ 3.01
CTTN-211ENST00000527622 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.79■■■■□ 3
CTTN-211ENST00000527622 TOP2BQ02880 1626 aa33.79■■■■□ 3
CTTN-211ENST00000527622 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.78■■■■□ 3
CTTN-211ENST00000527622 FBLN2P98095 1184 aa33.78■■■■□ 3
CTTN-211ENST00000527622 SYNJ1O43426 1573 aa33.77■■■■□ 3
CTTN-211ENST00000527622 SYNJ2O15056 1496 aa33.74■■■□□ 2.99
CTTN-211ENST00000527622 ARAP1Q96P48 1450 aa33.7■■■□□ 2.99
CTTN-211ENST00000527622 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.7■■■□□ 2.98
CTTN-211ENST00000527622 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
CTTN-211ENST00000527622 ADAMTS12P58397 1594 aa33.56■■■□□ 2.96
CTTN-211ENST00000527622 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.54■■■□□ 2.96
CTTN-211ENST00000527622 GRIN2AQ12879 1464 aa33.47■■■□□ 2.95
CTTN-211ENST00000527622 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.43■■■□□ 2.94
CTTN-211ENST00000527622 CEP170Q5SW79 1584 aa33.4■■■□□ 2.94
CTTN-211ENST00000527622 NUP160Q12769 1436 aa33.37■■■□□ 2.93
CTTN-211ENST00000527622 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.36■■■□□ 2.93
CTTN-211ENST00000527622 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.28■■■□□ 2.92
CTTN-211ENST00000527622 SHROOM2Q13796 1616 aa33.27■■■□□ 2.92
CTTN-211ENST00000527622 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.09■■■□□ 2.89
CTTN-211ENST00000527622 CUL7Q14999 1698 aa33.02■■■□□ 2.88
CTTN-211ENST00000527622 KIF27Q86VH2 1401 aa33.01■■■□□ 2.87
CTTN-211ENST00000527622 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
CTTN-211ENST00000527622 IGF1RP08069 1367 aa32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms