RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587195.5

ZNF444-203, Transcript of zinc finger protein 444, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF444, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444-203ENST00000587195 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.36■■■■■ 6.45
ZNF444-203ENST00000587195 ABCC9O60706 1549 aa50.43■■■■■ 5.66
ZNF444-203ENST00000587195 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.82■■■■■ 5.57
ZNF444-203ENST00000587195 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.9■■■■■ 5.26
ZNF444-203ENST00000587195 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.71■■■■■ 5.23
ZNF444-203ENST00000587195 NACADO15069 1562 aa47.27■■■■■ 5.16
ZNF444-203ENST00000587195 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.03■■■■■ 5.12
ZNF444-203ENST00000587195 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.94■■■■■ 5.1
ZNF444-203ENST00000587195 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.64■■■■■ 5.06
ZNF444-203ENST00000587195 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.45■■■■■ 5.03
ZNF444-203ENST00000587195 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.41■■■■■ 5.02
ZNF444-203ENST00000587195 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
ZNF444-203ENST00000587195 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.67■■■■■ 4.9
ZNF444-203ENST00000587195 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.62■■■■■ 4.89
ZNF444-203ENST00000587195 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.51■■■■■ 4.88
ZNF444-203ENST00000587195 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.48■■■■■ 4.87
ZNF444-203ENST00000587195 SCRIBQ14160 1630 aa45.41■■■■■ 4.86
ZNF444-203ENST00000587195 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
ZNF444-203ENST00000587195 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.31■■■■■ 4.68
ZNF444-203ENST00000587195 NCAPD3P42695 1498 aa43.7■■■■■ 4.59
ZNF444-203ENST00000587195 CUX2O14529 1486 aa43.63■■■■■ 4.57
ZNF444-203ENST00000587195 ERCC6Q03468 1493 aa43.53■■■■■ 4.56
ZNF444-203ENST00000587195 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.49■■■■■ 4.55
ZNF444-203ENST00000587195 SMARCA4P51532 1647 aa43.27■■■■■ 4.52
ZNF444-203ENST00000587195 SMARCA2P51531 1590 aa43.27■■■■■ 4.52
ZNF444-203ENST00000587195 HMGXB3Q12766 1538 aa43.26■■■■■ 4.52
ZNF444-203ENST00000587195 NESP48681 1621 aa43.2■■■■■ 4.51
ZNF444-203ENST00000587195 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
ZNF444-203ENST00000587195 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
ZNF444-203ENST00000587195 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.86■■■■■ 4.45
ZNF444-203ENST00000587195 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
ZNF444-203ENST00000587195 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.73■■■■■ 4.43
ZNF444-203ENST00000587195 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.68■■■■■ 4.42
ZNF444-203ENST00000587195 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.55■■■■■ 4.4
ZNF444-203ENST00000587195 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.54■■■■■ 4.4
ZNF444-203ENST00000587195 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.36■■■■■ 4.37
ZNF444-203ENST00000587195 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.19■■■■■ 4.34
ZNF444-203ENST00000587195 TRIM41Q8WV44 630 aa42.13■■■■■ 4.33
ZNF444-203ENST00000587195 WIZO95785 1651 aa42.12■■■■■ 4.33
ZNF444-203ENST00000587195 WDR62O43379 1518 aa42.1■■■■■ 4.33
ZNF444-203ENST00000587195 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.91■■■■■ 4.3
ZNF444-203ENST00000587195 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.85■■■■■ 4.29
ZNF444-203ENST00000587195 CFTRP13569 1480 aa41.75■■■■■ 4.27
ZNF444-203ENST00000587195 OSCARQ8IYS5 282 aa41.63■■■■■ 4.25
ZNF444-203ENST00000587195 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
ZNF444-203ENST00000587195 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
ZNF444-203ENST00000587195 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
ZNF444-203ENST00000587195 PRDM2Q13029 1718 aa41.17■■■■■ 4.18
ZNF444-203ENST00000587195 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
ZNF444-203ENST00000587195 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.12■■■■■ 4.17
ZNF444-203ENST00000587195 IFT140Q96RY7 1462 aa41.1■■■■■ 4.17
ZNF444-203ENST00000587195 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
ZNF444-203ENST00000587195 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
ZNF444-203ENST00000587195 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
ZNF444-203ENST00000587195 TOPBP1Q92547 1522 aa40.99■■■■■ 4.15
ZNF444-203ENST00000587195 ARHGEF11O15085 1522 aa40.91■■■■■ 4.14
ZNF444-203ENST00000587195 ABCC8Q09428 1581 aa40.84■■■■■ 4.13
ZNF444-203ENST00000587195 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
ZNF444-203ENST00000587195 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.77■■■■■ 4.12
ZNF444-203ENST00000587195 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.72■■■■■ 4.111e-6■■■■□ 23.4
ZNF444-203ENST00000587195 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.72■■■■■ 4.11
ZNF444-203ENST00000587195 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
ZNF444-203ENST00000587195 CHD1O14646 1710 aa40.61■■■■■ 4.09
ZNF444-203ENST00000587195 FBLN2P98095 1184 aa40.55■■■■■ 4.08
ZNF444-203ENST00000587195 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
ZNF444-203ENST00000587195 ARAP1Q96P48 1450 aa40.49■■■■■ 4.07
ZNF444-203ENST00000587195 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.45■■■■■ 4.07
ZNF444-203ENST00000587195 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
ZNF444-203ENST00000587195 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
ZNF444-203ENST00000587195 SOGA1O94964 1423 aa40.38■■■■■ 4.05
ZNF444-203ENST00000587195 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.23■■■■■ 4.03
ZNF444-203ENST00000587195 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.21■■■■■ 4.03
ZNF444-203ENST00000587195 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
ZNF444-203ENST00000587195 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.16■■■■■ 4.02
ZNF444-203ENST00000587195 WDR97A6NE52 1622 aa40.15■■■■■ 4.02
ZNF444-203ENST00000587195 CUX1P39880 1505 aa40.11■■■■■ 4.01
ZNF444-203ENST00000587195 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
ZNF444-203ENST00000587195 GRIN2BQ13224 1484 aa40.05■■■■■ 4
ZNF444-203ENST00000587195 SYNJ1O43426 1573 aa40.05■■■■■ 4
ZNF444-203ENST00000587195 SYNJ2O15056 1496 aa39.98■■■■□ 3.99
ZNF444-203ENST00000587195 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.85■■■■□ 3.97
ZNF444-203ENST00000587195 PBRM1Q86U86 1689 aa39.8■■■■□ 3.96
ZNF444-203ENST00000587195 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.72■■■■□ 3.95
ZNF444-203ENST00000587195 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.68■■■■□ 3.94
ZNF444-203ENST00000587195 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
ZNF444-203ENST00000587195 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.55■■■■□ 3.92
ZNF444-203ENST00000587195 GRIN2AQ12879 1464 aa39.54■■■■□ 3.92
ZNF444-203ENST00000587195 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.47■■■■□ 3.91
ZNF444-203ENST00000587195 NUP160Q12769 1436 aa39.44■■■■□ 3.9
ZNF444-203ENST00000587195 CEP170Q5SW79 1584 aa39.42■■■■□ 3.9
ZNF444-203ENST00000587195 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
ZNF444-203ENST00000587195 ADAMTS12P58397 1594 aa39.42■■■■□ 3.9
ZNF444-203ENST00000587195 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.32■■■■□ 3.89
ZNF444-203ENST00000587195 TOP2BQ02880 1626 aa39.29■■■■□ 3.88
ZNF444-203ENST00000587195 SHROOM2Q13796 1616 aa39.29■■■■□ 3.88
ZNF444-203ENST00000587195 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.28■■■■□ 3.88
ZNF444-203ENST00000587195 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.19■■■■□ 3.86
ZNF444-203ENST00000587195 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
ZNF444-203ENST00000587195 JPH4Q96JJ6 628 aa39.09■■■■□ 3.85
ZNF444-203ENST00000587195 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms