Protein–RNA interactions for Protein: Q17RY0

CPEB4, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4Q17RY0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.742e-63■■■■■ 470.3
CPEB4Q17RY0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-63■■■■■ 470.3
CPEB4Q17RY0 NFKBIA-203ENST00000554001 1396 ntTSL 513.23□□□□□ -0.292e-63■■■■■ 470.3
CPEB4Q17RY0 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-63■■■■■ 470.3
CPEB4Q17RY0 NFKBIA-204ENST00000555371 690 ntTSL 39.49□□□□□ -0.892e-63■■■■■ 470.3
CPEB4Q17RY0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.392e-28■■■■■ 180.1
CPEB4Q17RY0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-19■■■■■ 157.7
CPEB4Q17RY0 KDSR-205ENST00000586791 3384 ntTSL 27.97□□□□□ -1.131e-19■■■■■ 157.7
CPEB4Q17RY0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.265e-18■■■■■ 154.8
CPEB4Q17RY0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.195e-18■■■■■ 154.8
CPEB4Q17RY0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-10■■■■■ 148.4
CPEB4Q17RY0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 148.4
CPEB4Q17RY0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 148.4
CPEB4Q17RY0 RALGDS-213ENST00000493438 4602 ntTSL 213.3□□□□□ -0.282e-10■■■■■ 148.4
CPEB4Q17RY0 RALGDS-211ENST00000482648 5596 ntTSL 213.11□□□□□ -0.312e-10■■■■■ 148.4
CPEB4Q17RY0 RALGDS-208ENST00000469972 5817 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.372e-10■■■■■ 148.4
CPEB4Q17RY0 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.492e-10■■■■■ 148.4
CPEB4Q17RY0 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 148.4
CPEB4Q17RY0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.938e-7■■■■■ 130.9
CPEB4Q17RY0 GET4-206ENST00000464468 676 ntTSL 315.9■□□□□ 0.148e-7■■■■■ 130.9
CPEB4Q17RY0 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 214.27□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 130.9
CPEB4Q17RY0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 130.9
CPEB4Q17RY0 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)20.02■□□□□ 0.84e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 217.53■□□□□ 0.44e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 216.75■□□□□ 0.274e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.144e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.514e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.934e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 38.32□□□□□ -1.084e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 58.32□□□□□ -1.084e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.35□□□□□ -1.234e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 56.05□□□□□ -1.444e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 55.58□□□□□ -1.524e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 45.27□□□□□ -1.574e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.054e-9■■■■■ 118.1
CPEB4Q17RY0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 114.6
CPEB4Q17RY0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 114.6
CPEB4Q17RY0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.578e-8■■■■■ 98.7
CPEB4Q17RY0 GNAI2-205ENST00000441156 2168 ntTSL 221.94■■□□□ 1.18e-8■■■■■ 98.7
CPEB4Q17RY0 GNAI2-206ENST00000446079 2086 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 98.7
CPEB4Q17RY0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.298e-8■■■■■ 98.7
CPEB4Q17RY0 GNAI2-210ENST00000490122 2445 ntTSL 213.02□□□□□ -0.338e-8■■■■■ 98.7
CPEB4Q17RY0 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.358e-8■■■■■ 98.7
CPEB4Q17RY0 GNAI2-211ENST00000491100 3886 ntTSL 28.01□□□□□ -1.138e-8■■■■■ 98.7
CPEB4Q17RY0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-12■■■■■ 92.3
CPEB4Q17RY0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.071e-12■■■■■ 92.3
CPEB4Q17RY0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.267e-14■■■■■ 87.1
CPEB4Q17RY0 KTN1-212ENST00000554294 564 ntTSL 56.81□□□□□ -1.325e-13■■■■■ 83.1
CPEB4Q17RY0 KTN1-201ENST00000334975 2485 ntTSL 26.77□□□□□ -1.325e-13■■■■■ 83.1
CPEB4Q17RY0 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.425e-13■■■■■ 83.1
CPEB4Q17RY0 KTN1-220ENST00000555172 1985 ntTSL 24.29□□□□□ -1.725e-13■■■■■ 83.1
CPEB4Q17RY0 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.945e-13■■■■■ 83.1
CPEB4Q17RY0 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.035e-13■■■■■ 83.1
CPEB4Q17RY0 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.035e-13■■■■■ 83.1
CPEB4Q17RY0 KTN1-208ENST00000459737 4793 ntTSL 1 (best)2.13□□□□□ -2.075e-13■■■■■ 83.1
CPEB4Q17RY0 KTN1-224ENST00000556631 5299 ntTSL 1 (best)1.88□□□□□ -2.115e-13■■■■■ 83.1
CPEB4Q17RY0 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.145e-13■■■■■ 83.1
CPEB4Q17RY0 DCAF1-201ENST00000335891 4114 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.029e-22■■■■■ 82.3
CPEB4Q17RY0 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.089e-22■■■■■ 82.3
CPEB4Q17RY0 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.119e-22■■■■■ 82.3
CPEB4Q17RY0 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.353e-12■■■■■ 78.5
CPEB4Q17RY0 SRSF4-206ENST00000605204 1399 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.41e-11■■■■■ 73.9
CPEB4Q17RY0 SRSF4-202ENST00000466448 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.87■□□□□ 0.291e-11■■■■■ 73.9
CPEB4Q17RY0 SRSF4-204ENST00000489898 393 ntTSL 310.66□□□□□ -0.71e-11■■■■■ 73.9
CPEB4Q17RY0 SRSF4-205ENST00000497015 516 ntTSL 28.83□□□□□ -11e-11■■■■■ 73.9
CPEB4Q17RY0 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.332e-27■■■■■ 70.1
CPEB4Q17RY0 CELF1-207ENST00000524648 393 ntTSL 27.96□□□□□ -1.142e-27■■■■■ 70.1
CPEB4Q17RY0 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.172e-27■■■■■ 70.1
CPEB4Q17RY0 CELF1-220ENST00000539455 800 ntTSL 54.9□□□□□ -1.632e-27■■■■■ 70.1
CPEB4Q17RY0 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.524e-10■■■■■ 64.6
CPEB4Q17RY0 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.624e-10■■■■■ 64.6
CPEB4Q17RY0 MPHOSPH10-204ENST00000493360 1584 ntTSL 210.32□□□□□ -0.764e-10■■■■■ 64.6
CPEB4Q17RY0 SP4-204ENST00000448246 4293 ntTSL 59.45□□□□□ -0.94e-10■■■■■ 64.6
CPEB4Q17RY0 KLHL12-202ENST00000367259 2257 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.084e-10■■■■■ 64.6
CPEB4Q17RY0 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.164e-10■■■■■ 64.6
CPEB4Q17RY0 EMSY-214ENST00000532719 1105 ntTSL 1 (best)6.77□□□□□ -1.338e-10■■■■■ 63.3
CPEB4Q17RY0 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.538e-10■■■■■ 63.3
CPEB4Q17RY0 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.598e-10■■■■■ 63.3
CPEB4Q17RY0 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.718e-10■■■■■ 63.3
CPEB4Q17RY0 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.858e-10■■■■■ 63.3
CPEB4Q17RY0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.332e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 PDIA3-202ENST00000434494 2107 ntTSL 213.43□□□□□ -0.262e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.412e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.62e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.622e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 PDIA3-201ENST00000300289 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 CDC14A-204ENST00000455467 841 ntTSL 36.91□□□□□ -1.32e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 PDIA3-206ENST00000497349 739 ntTSL 26.91□□□□□ -1.32e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.672e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.12e-9■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 60
CPEB4Q17RY0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.359e-10■■■■■ 57.5
CPEB4Q17RY0 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.639e-10■■■■■ 57.5
Retrieved 100 of 1,751 protein–RNA pairs in 18.4 ms