RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513618.1

SPATA20-223, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 2

Gene SPATA20, Length 629 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-223	ENST00000513618	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		44.26	■■■■■ 4.68
SPATA20-223	ENST00000513618	ABCC9	O60706	1549 aa		39.8	■■■■□ 3.96
SPATA20-223	ENST00000513618	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.75	■■■■□ 3.95
SPATA20-223	ENST00000513618	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.91	■■■■□ 3.66
SPATA20-223	ENST00000513618	NACAD	O15069	1562 aa		37.64	■■■■□ 3.62
SPATA20-223	ENST00000513618	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.38	■■■■□ 3.57
SPATA20-223	ENST00000513618	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.38	■■■■□ 3.57
SPATA20-223	ENST00000513618	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.15	■■■■□ 3.54
SPATA20-223	ENST00000513618	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.04	■■■■□ 3.52
SPATA20-223	ENST00000513618	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.89	■■■■□ 3.5
SPATA20-223	ENST00000513618	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.73	■■■■□ 3.47
SPATA20-223	ENST00000513618	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.67	■■■■□ 3.46
SPATA20-223	ENST00000513618	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.62	■■■■□ 3.45
SPATA20-223	ENST00000513618	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.39	■■■■□ 3.42
SPATA20-223	ENST00000513618	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.15	■■■■□ 3.38
SPATA20-223	ENST00000513618	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.95	■■■■□ 3.35
SPATA20-223	ENST00000513618	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.9	■■■■□ 3.34
SPATA20-223	ENST00000513618	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.88	■■■■□ 3.33
SPATA20-223	ENST00000513618	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.77	■■■■□ 3.16
SPATA20-223	ENST00000513618	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.61	■■■■□ 3.13
SPATA20-223	ENST00000513618	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.54	■■■■□ 3.12
SPATA20-223	ENST00000513618	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.52	■■■■□ 3.12
SPATA20-223	ENST00000513618	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.49	■■■■□ 3.11
SPATA20-223	ENST00000513618	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.48	■■■■□ 3.11
SPATA20-223	ENST00000513618	CUX2	O14529	1486 aa		34.43	■■■■□ 3.1
SPATA20-223	ENST00000513618	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.42	■■■■□ 3.1
SPATA20-223	ENST00000513618	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.4	■■■■□ 3.1
SPATA20-223	ENST00000513618	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.28	■■■■□ 3.08
SPATA20-223	ENST00000513618	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.23	■■■■□ 3.07
SPATA20-223	ENST00000513618	NES	P48681	1621 aa		34.14	■■■■□ 3.06
SPATA20-223	ENST00000513618	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.06	■■■■□ 3.04
SPATA20-223	ENST00000513618	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.98	■■■■□ 3.03
SPATA20-223	ENST00000513618	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
SPATA20-223	ENST00000513618	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.82	■■■■□ 3
SPATA20-223	ENST00000513618	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SPATA20-223	ENST00000513618	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.66	■■■□□ 2.98
SPATA20-223	ENST00000513618	WIZ	O95785	1651 aa		33.61	■■■□□ 2.97
SPATA20-223	ENST00000513618	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SPATA20-223	ENST00000513618	WDR62	O43379	1518 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SPATA20-223	ENST00000513618	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
SPATA20-223	ENST00000513618	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SPATA20-223	ENST00000513618	CFTR	P13569	1480 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SPATA20-223	ENST00000513618	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SPATA20-223	ENST00000513618	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
SPATA20-223	ENST00000513618	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
SPATA20-223	ENST00000513618	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SPATA20-223	ENST00000513618	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SPATA20-223	ENST00000513618	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SPATA20-223	ENST00000513618	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SPATA20-223	ENST00000513618	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SPATA20-223	ENST00000513618	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SPATA20-223	ENST00000513618	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SPATA20-223	ENST00000513618	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SPATA20-223	ENST00000513618	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
SPATA20-223	ENST00000513618	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
SPATA20-223	ENST00000513618	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SPATA20-223	ENST00000513618	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SPATA20-223	ENST00000513618	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SPATA20-223	ENST00000513618	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.29	■■■□□ 2.76
SPATA20-223	ENST00000513618	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SPATA20-223	ENST00000513618	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SPATA20-223	ENST00000513618	SOGA1	O94964	1423 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SPATA20-223	ENST00000513618	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SPATA20-223	ENST00000513618	FBLN2	P98095	1184 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SPATA20-223	ENST00000513618	CHD1	O14646	1710 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SPATA20-223	ENST00000513618	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
SPATA20-223	ENST00000513618	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SPATA20-223	ENST00000513618	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SPATA20-223	ENST00000513618	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SPATA20-223	ENST00000513618	CUX1	P39880	1505 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SPATA20-223	ENST00000513618	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SPATA20-223	ENST00000513618	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
SPATA20-223	ENST00000513618	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SPATA20-223	ENST00000513618	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SPATA20-223	ENST00000513618	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
SPATA20-223	ENST00000513618	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SPATA20-223	ENST00000513618	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SPATA20-223	ENST00000513618	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SPATA20-223	ENST00000513618	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SPATA20-223	ENST00000513618	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SPATA20-223	ENST00000513618	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SPATA20-223	ENST00000513618	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
SPATA20-223	ENST00000513618	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SPATA20-223	ENST00000513618	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SPATA20-223	ENST00000513618	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.62	■■■□□ 2.65
SPATA20-223	ENST00000513618	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SPATA20-223	ENST00000513618	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SPATA20-223	ENST00000513618	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SPATA20-223	ENST00000513618	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SPATA20-223	ENST00000513618	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SPATA20-223	ENST00000513618	NUP160	Q12769	1436 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SPATA20-223	ENST00000513618	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SPATA20-223	ENST00000513618	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.32	■■■□□ 2.6
SPATA20-223	ENST00000513618	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.26	■■■□□ 2.59
SPATA20-223	ENST00000513618	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SPATA20-223	ENST00000513618	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
SPATA20-223	ENST00000513618	JPH4	Q96JJ6	628 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SPATA20-223	ENST00000513618	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.98	■■■□□ 2.55
SPATA20-223	ENST00000513618	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30.95	■■■□□ 2.54

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