RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511347.5

SPATA20-217, Transcript of spermatogenesis associated 20, humanhuman

TSL 5

Gene SPATA20, Length 1,035 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20-217ENST00000511347 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.96■■■■□ 3.83
SPATA20-217ENST00000511347 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.55■■■■□ 3.12
SPATA20-217ENST00000511347 ABCC9O60706 1549 aa34■■■■□ 3.03
SPATA20-217ENST00000511347 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.71■■■□□ 2.83
SPATA20-217ENST00000511347 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.62■■■□□ 2.81
SPATA20-217ENST00000511347 NACADO15069 1562 aa32.58■■■□□ 2.81
SPATA20-217ENST00000511347 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
SPATA20-217ENST00000511347 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.36■■■□□ 2.77
SPATA20-217ENST00000511347 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.21■■■□□ 2.75
SPATA20-217ENST00000511347 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
SPATA20-217ENST00000511347 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.78■■■□□ 2.68
SPATA20-217ENST00000511347 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.64■■■□□ 2.65
SPATA20-217ENST00000511347 SCRIBQ14160 1630 aa31.6■■■□□ 2.65
SPATA20-217ENST00000511347 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.44■■■□□ 2.62
SPATA20-217ENST00000511347 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.28■■■□□ 2.6
SPATA20-217ENST00000511347 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
SPATA20-217ENST00000511347 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.7■■■□□ 2.51
SPATA20-217ENST00000511347 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.56■■■□□ 2.48
SPATA20-217ENST00000511347 SMARCA4P51532 1647 aa30.21■■■□□ 2.43
SPATA20-217ENST00000511347 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
SPATA20-217ENST00000511347 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.12■■■□□ 2.41
SPATA20-217ENST00000511347 NCAPD3P42695 1498 aa30.12■■■□□ 2.41
SPATA20-217ENST00000511347 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.04■■■□□ 2.4
SPATA20-217ENST00000511347 SMARCA2P51531 1590 aa30.03■■■□□ 2.4
SPATA20-217ENST00000511347 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.9■■■□□ 2.38
SPATA20-217ENST00000511347 HMGXB3Q12766 1538 aa29.89■■■□□ 2.38
SPATA20-217ENST00000511347 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
SPATA20-217ENST00000511347 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
SPATA20-217ENST00000511347 WIZO95785 1651 aa29.67■■■□□ 2.34
SPATA20-217ENST00000511347 NESP48681 1621 aa29.41■■■□□ 2.3
SPATA20-217ENST00000511347 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
SPATA20-217ENST00000511347 ERCC6Q03468 1493 aa29.3■■■□□ 2.28
SPATA20-217ENST00000511347 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.26■■■□□ 2.28
SPATA20-217ENST00000511347 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.26■■■□□ 2.27
SPATA20-217ENST00000511347 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.14■■■□□ 2.26
SPATA20-217ENST00000511347 CUX2O14529 1486 aa29.1■■■□□ 2.25
SPATA20-217ENST00000511347 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.08■■■□□ 2.25
SPATA20-217ENST00000511347 CFTRP13569 1480 aa29.04■■■□□ 2.24
SPATA20-217ENST00000511347 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SPATA20-217ENST00000511347 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.95■■■□□ 2.22
SPATA20-217ENST00000511347 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
SPATA20-217ENST00000511347 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.89■■■□□ 2.22
SPATA20-217ENST00000511347 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.84■■■□□ 2.21
SPATA20-217ENST00000511347 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.82■■■□□ 2.2
SPATA20-217ENST00000511347 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.8■■■□□ 2.2
SPATA20-217ENST00000511347 WDR62O43379 1518 aa28.69■■■□□ 2.18
SPATA20-217ENST00000511347 PRDM2Q13029 1718 aa28.64■■■□□ 2.18
SPATA20-217ENST00000511347 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SPATA20-217ENST00000511347 TOPBP1Q92547 1522 aa28.41■■■□□ 2.14
SPATA20-217ENST00000511347 ABCC8Q09428 1581 aa28.4■■■□□ 2.14
SPATA20-217ENST00000511347 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.34■■■□□ 2.13
SPATA20-217ENST00000511347 IFT140Q96RY7 1462 aa28.26■■■□□ 2.11
SPATA20-217ENST00000511347 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
SPATA20-217ENST00000511347 CUX1P39880 1505 aa28.17■■■□□ 2.1
SPATA20-217ENST00000511347 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
SPATA20-217ENST00000511347 SOGA1O94964 1423 aa28.1■■■□□ 2.09
SPATA20-217ENST00000511347 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.09■■■□□ 2.09
SPATA20-217ENST00000511347 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.08■■■□□ 2.09
SPATA20-217ENST00000511347 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SPATA20-217ENST00000511347 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.02■■■□□ 2.087e-8■■■□□ 18.3
SPATA20-217ENST00000511347 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28■■■□□ 2.07
SPATA20-217ENST00000511347 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
SPATA20-217ENST00000511347 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SPATA20-217ENST00000511347 OSCARQ8IYS5 282 aa27.89■■■□□ 2.06
SPATA20-217ENST00000511347 TOP2BQ02880 1626 aa27.89■■■□□ 2.05
SPATA20-217ENST00000511347 SYNJ1O43426 1573 aa27.88■■■□□ 2.05
SPATA20-217ENST00000511347 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.85■■■□□ 2.05
SPATA20-217ENST00000511347 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.82■■■□□ 2.04
SPATA20-217ENST00000511347 WDR97A6NE52 1622 aa27.81■■■□□ 2.04
SPATA20-217ENST00000511347 GRIN2BQ13224 1484 aa27.74■■■□□ 2.03
SPATA20-217ENST00000511347 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.74■■■□□ 2.03
SPATA20-217ENST00000511347 FBLN2P98095 1184 aa27.73■■■□□ 2.03
SPATA20-217ENST00000511347 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.71■■■□□ 2.03
SPATA20-217ENST00000511347 TRIM41Q8WV44 630 aa27.67■■■□□ 2.02
SPATA20-217ENST00000511347 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.66■■■□□ 2.02
SPATA20-217ENST00000511347 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
SPATA20-217ENST00000511347 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
SPATA20-217ENST00000511347 CHD1O14646 1710 aa27.58■■■□□ 2.01
SPATA20-217ENST00000511347 PBRM1Q86U86 1689 aa27.56■■■□□ 2
SPATA20-217ENST00000511347 SYNJ2O15056 1496 aa27.56■■■□□ 2
SPATA20-217ENST00000511347 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.46■■□□□ 1.99
SPATA20-217ENST00000511347 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.42■■□□□ 1.98
SPATA20-217ENST00000511347 KIF27Q86VH2 1401 aa27.42■■□□□ 1.98
SPATA20-217ENST00000511347 ADAMTS12P58397 1594 aa27.4■■□□□ 1.98
SPATA20-217ENST00000511347 GRIN2AQ12879 1464 aa27.37■■□□□ 1.97
SPATA20-217ENST00000511347 IGF1RP08069 1367 aa27.36■■□□□ 1.97
SPATA20-217ENST00000511347 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.34■■□□□ 1.97
SPATA20-217ENST00000511347 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.34■■□□□ 1.97
SPATA20-217ENST00000511347 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.34■■□□□ 1.97
SPATA20-217ENST00000511347 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.34■■□□□ 1.97
SPATA20-217ENST00000511347 ARHGEF11O15085 1522 aa27.33■■□□□ 1.97
SPATA20-217ENST00000511347 NUP160Q12769 1436 aa27.26■■□□□ 1.95
SPATA20-217ENST00000511347 CEP170Q5SW79 1584 aa27.22■■□□□ 1.95
SPATA20-217ENST00000511347 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.19■■□□□ 1.94
SPATA20-217ENST00000511347 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.19■■□□□ 1.94
SPATA20-217ENST00000511347 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.17■■□□□ 1.94
SPATA20-217ENST00000511347 CUL7Q14999 1698 aa27.15■■□□□ 1.94
SPATA20-217ENST00000511347 ARAP1Q96P48 1450 aa27.13■■□□□ 1.93
SPATA20-217ENST00000511347 JPH4Q96JJ6 628 aa27.06■■□□□ 1.92
SPATA20-217ENST00000511347 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.01■■□□□ 1.91
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