RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426343.5

HDLBP-212, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-212ENST00000426343 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.89■■■■■ 4.62
HDLBP-212ENST00000426343 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.14■■■■□ 3.86
HDLBP-212ENST00000426343 ABCC9O60706 1549 aa38.89■■■■□ 3.82
HDLBP-212ENST00000426343 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.16■■■■□ 3.54
HDLBP-212ENST00000426343 NACADO15069 1562 aa37.02■■■■□ 3.52
HDLBP-212ENST00000426343 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.97■■■■□ 3.51
HDLBP-212ENST00000426343 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.67■■■■□ 3.46
HDLBP-212ENST00000426343 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
HDLBP-212ENST00000426343 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.33■■■■□ 3.41
HDLBP-212ENST00000426343 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.31■■■■□ 3.4
HDLBP-212ENST00000426343 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.26■■■■□ 3.4
HDLBP-212ENST00000426343 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.11■■■■□ 3.37
HDLBP-212ENST00000426343 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.03■■■■□ 3.36
HDLBP-212ENST00000426343 SCRIBQ14160 1630 aa35.68■■■■□ 3.3
HDLBP-212ENST00000426343 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.67■■■■□ 3.3
HDLBP-212ENST00000426343 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
HDLBP-212ENST00000426343 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.1■■■■□ 3.21
HDLBP-212ENST00000426343 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.03■■■■□ 3.2
HDLBP-212ENST00000426343 NCAPD3P42695 1498 aa34.23■■■■□ 3.07
HDLBP-212ENST00000426343 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.14■■■■□ 3.06
HDLBP-212ENST00000426343 SMARCA4P51532 1647 aa34.1■■■■□ 3.05
HDLBP-212ENST00000426343 SMARCA2P51531 1590 aa34.03■■■■□ 3.04
HDLBP-212ENST00000426343 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
HDLBP-212ENST00000426343 HMGXB3Q12766 1538 aa33.93■■■■□ 3.02
HDLBP-212ENST00000426343 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.81■■■■□ 3
HDLBP-212ENST00000426343 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
HDLBP-212ENST00000426343 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.8■■■■□ 3
HDLBP-212ENST00000426343 ERCC6Q03468 1493 aa33.56■■■□□ 2.96
HDLBP-212ENST00000426343 NESP48681 1621 aa33.48■■■□□ 2.95
HDLBP-212ENST00000426343 CUX2O14529 1486 aa33.42■■■□□ 2.94
HDLBP-212ENST00000426343 WIZO95785 1651 aa33.33■■■□□ 2.93
HDLBP-212ENST00000426343 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.32■■■□□ 2.92
HDLBP-212ENST00000426343 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
HDLBP-212ENST00000426343 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.22■■■□□ 2.91
HDLBP-212ENST00000426343 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.2■■■□□ 2.91
HDLBP-212ENST00000426343 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.1■■■□□ 2.89
HDLBP-212ENST00000426343 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
HDLBP-212ENST00000426343 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
HDLBP-212ENST00000426343 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.94■■■□□ 2.86
HDLBP-212ENST00000426343 CFTRP13569 1480 aa32.88■■■□□ 2.85
HDLBP-212ENST00000426343 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.84■■■□□ 2.85
HDLBP-212ENST00000426343 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.77■■■□□ 2.84
HDLBP-212ENST00000426343 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.77■■■□□ 2.84
HDLBP-212ENST00000426343 WDR62O43379 1518 aa32.72■■■□□ 2.83
HDLBP-212ENST00000426343 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.67■■■□□ 2.82
HDLBP-212ENST00000426343 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
HDLBP-212ENST00000426343 PRDM2Q13029 1718 aa32.33■■■□□ 2.77
HDLBP-212ENST00000426343 ABCC8Q09428 1581 aa32.2■■■□□ 2.75
HDLBP-212ENST00000426343 TOPBP1Q92547 1522 aa32.18■■■□□ 2.74
HDLBP-212ENST00000426343 IFT140Q96RY7 1462 aa32.14■■■□□ 2.74
HDLBP-212ENST00000426343 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
HDLBP-212ENST00000426343 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.07■■■□□ 2.72
HDLBP-212ENST00000426343 OSCARQ8IYS5 282 aa32.04■■■□□ 2.72
HDLBP-212ENST00000426343 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
HDLBP-212ENST00000426343 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
HDLBP-212ENST00000426343 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
HDLBP-212ENST00000426343 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.8■■■□□ 2.682e-16■■■■□ 25
HDLBP-212ENST00000426343 SOGA1O94964 1423 aa31.8■■■□□ 2.68
HDLBP-212ENST00000426343 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
HDLBP-212ENST00000426343 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.76■■■□□ 2.67
HDLBP-212ENST00000426343 CUX1P39880 1505 aa31.74■■■□□ 2.67
HDLBP-212ENST00000426343 TRIM41Q8WV44 630 aa31.72■■■□□ 2.67
HDLBP-212ENST00000426343 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.72■■■□□ 2.67
HDLBP-212ENST00000426343 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
HDLBP-212ENST00000426343 WDR97A6NE52 1622 aa31.56■■■□□ 2.64
HDLBP-212ENST00000426343 FBLN2P98095 1184 aa31.55■■■□□ 2.64
HDLBP-212ENST00000426343 GRIN2BQ13224 1484 aa31.46■■■□□ 2.63
HDLBP-212ENST00000426343 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.45■■■□□ 2.62
HDLBP-212ENST00000426343 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
HDLBP-212ENST00000426343 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.41■■■□□ 2.62
HDLBP-212ENST00000426343 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
HDLBP-212ENST00000426343 CHD1O14646 1710 aa31.4■■■□□ 2.62
HDLBP-212ENST00000426343 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.39■■■□□ 2.62
HDLBP-212ENST00000426343 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.39■■■□□ 2.62
HDLBP-212ENST00000426343 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.39■■■□□ 2.62
HDLBP-212ENST00000426343 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.39■■■□□ 2.62
HDLBP-212ENST00000426343 ARHGEF11O15085 1522 aa31.39■■■□□ 2.61
HDLBP-212ENST00000426343 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.38■■■□□ 2.61
HDLBP-212ENST00000426343 SYNJ2O15056 1496 aa31.3■■■□□ 2.6
HDLBP-212ENST00000426343 TOP2BQ02880 1626 aa31.29■■■□□ 2.6
HDLBP-212ENST00000426343 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.25■■■□□ 2.59
HDLBP-212ENST00000426343 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.24■■■□□ 2.59
HDLBP-212ENST00000426343 SYNJ1O43426 1573 aa31.24■■■□□ 2.59
HDLBP-212ENST00000426343 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.24■■■□□ 2.59
HDLBP-212ENST00000426343 PBRM1Q86U86 1689 aa31.17■■■□□ 2.58
HDLBP-212ENST00000426343 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.17■■■□□ 2.58
HDLBP-212ENST00000426343 ARAP1Q96P48 1450 aa31.11■■■□□ 2.57
HDLBP-212ENST00000426343 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.03■■■□□ 2.56
HDLBP-212ENST00000426343 GRIN2AQ12879 1464 aa31.02■■■□□ 2.56
HDLBP-212ENST00000426343 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.01■■■□□ 2.55
HDLBP-212ENST00000426343 ADAMTS12P58397 1594 aa30.99■■■□□ 2.55
HDLBP-212ENST00000426343 NUP160Q12769 1436 aa30.94■■■□□ 2.54
HDLBP-212ENST00000426343 CEP170Q5SW79 1584 aa30.83■■■□□ 2.53
HDLBP-212ENST00000426343 KIF27Q86VH2 1401 aa30.8■■■□□ 2.52
HDLBP-212ENST00000426343 IGF1RP08069 1367 aa30.78■■■□□ 2.52
HDLBP-212ENST00000426343 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
HDLBP-212ENST00000426343 JPH4Q96JJ6 628 aa30.7■■■□□ 2.51
HDLBP-212ENST00000426343 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.68■■■□□ 2.5
HDLBP-212ENST00000426343 SHROOM2Q13796 1616 aa30.67■■■□□ 2.5
HDLBP-212ENST00000426343 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms