Protein–RNA interactions for Protein: P23246

SFPQ, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFPQP23246 DNAAF5-203ENST00000437419 585 ntTSL 522.46■■□□□ 1.193e-9■■■■■ 47.3
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SFPQP23246 DNAAF5-205ENST00000440747 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 219.44■□□□□ 0.73e-9■■■■■ 47.3
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SFPQP23246 SMYD3-203ENST00000391836 732 ntTSL 512.86□□□□□ -0.353e-10■■■■■ 44.5
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SFPQP23246 ETV4-206ENST00000585508 760 ntTSL 521.4■■□□□ 1.028e-10■■■■■ 42.5
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SFPQP23246 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.978e-10■■■■■ 42.5
SFPQP23246 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.748e-10■■■■■ 42.5
SFPQP23246 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.618e-10■■■■■ 42.5
SFPQP23246 ETV4-210ENST00000590236 616 ntTSL 317.76■□□□□ 0.438e-10■■■■■ 42.5
SFPQP23246 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.388e-10■■■■■ 42.5
SFPQP23246 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.238e-10■■■■■ 42.5
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SFPQP23246 ETV4-209ENST00000587151 582 ntTSL 515.79■□□□□ 0.128e-10■■■■■ 42.5
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SFPQP23246 ATXN10-205ENST00000451241 514 ntTSL 36□□□□□ -1.451e-11■■■■■ 41.9
SFPQP23246 ATXN10-210ENST00000493643 617 ntTSL 55.35□□□□□ -1.551e-11■■■■■ 41.9
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SFPQP23246 MAP4K3-204ENST00000429397 689 ntTSL 326.93■■□□□ 1.92e-8■■■■■ 30.9
SFPQP23246 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.42e-8■■■■■ 30.9
SFPQP23246 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 30.9
SFPQP23246 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.712e-8■■■■■ 30.9
SFPQP23246 FBXW7-209ENST00000604095 755 ntTSL 314.36□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 30.9
SFPQP23246 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 30.9
SFPQP23246 FBXW7-212ENST00000604872 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 30.9
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SFPQP23246 AKT2-214ENST00000456441 582 ntTSL 324.12■■□□□ 1.454e-7■■■■■ 30.9
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