RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489616.1

THUMPD3-AS1-206, THUMPD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene THUMPD3-AS1, Length 583 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.52■■■■■ 4.08
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ABCC9O60706 1549 aa37.11■■■■□ 3.53
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.67■■■■□ 3.46
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.2■■■■□ 3.23
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.16■■■■□ 3.22
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NACADO15069 1562 aa34.79■■■■□ 3.16
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.43■■■■□ 3.1
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.4■■■■□ 3.1
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.29■■■■□ 3.08
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.14■■■■□ 3.06
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.08■■■■□ 3.05
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.7■■■□□ 2.99
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.53■■■□□ 2.96
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.52■■■□□ 2.96
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.49■■■□□ 2.95
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SCRIBQ14160 1630 aa33.32■■■□□ 2.92
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.81■■■□□ 2.84
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CUX2O14529 1486 aa32.29■■■□□ 2.76
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ERCC6Q03468 1493 aa32.16■■■□□ 2.74
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NCAPD3P42695 1498 aa32.09■■■□□ 2.73
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.9■■■□□ 2.7
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SMARCA2P51531 1590 aa31.84■■■□□ 2.69
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 HMGXB3Q12766 1538 aa31.84■■■□□ 2.69
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SMARCA4P51532 1647 aa31.75■■■□□ 2.67
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NESP48681 1621 aa31.7■■■□□ 2.66
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.48■■■□□ 2.63
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.45■■■□□ 2.63
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.33■■■□□ 2.61
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.31■■■□□ 2.6
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.19■■■□□ 2.58
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TRIM41Q8WV44 630 aa31.15■■■□□ 2.58
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.08■■■□□ 2.57
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.08■■■□□ 2.57
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 WDR62O43379 1518 aa31.02■■■□□ 2.56
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.85■■■□□ 2.53
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 WIZO95785 1651 aa30.78■■■□□ 2.52
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.75■■■□□ 2.51
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 OSCARQ8IYS5 282 aa30.67■■■□□ 2.5
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CFTRP13569 1480 aa30.62■■■□□ 2.49
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PRDM2Q13029 1718 aa30.3■■■□□ 2.44
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 IFT140Q96RY7 1462 aa30.25■■■□□ 2.43
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ARHGEF11O15085 1522 aa30.2■■■□□ 2.42
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TOPBP1Q92547 1522 aa30.09■■■□□ 2.41
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ABCC8Q09428 1581 aa30.04■■■□□ 2.4
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.03■■■□□ 2.4
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.97■■■□□ 2.39
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.96■■■□□ 2.39
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CHD1O14646 1710 aa29.91■■■□□ 2.38
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.378e-9■□□□□ 8.7
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ARAP1Q96P48 1450 aa29.85■■■□□ 2.37
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 FBLN2P98095 1184 aa29.79■■■□□ 2.36
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.61■■■□□ 2.33
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 WDR97A6NE52 1622 aa29.6■■■□□ 2.33
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SOGA1O94964 1423 aa29.6■■■□□ 2.33
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.57■■■□□ 2.32
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.57■■■□□ 2.32
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SYNJ1O43426 1573 aa29.54■■■□□ 2.32
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.48■■■□□ 2.31
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 GRIN2BQ13224 1484 aa29.44■■■□□ 2.3
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SYNJ2O15056 1496 aa29.41■■■□□ 2.3
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CUX1P39880 1505 aa29.35■■■□□ 2.29
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.29■■■□□ 2.28
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PBRM1Q86U86 1689 aa29.27■■■□□ 2.28
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.14■■■□□ 2.26
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.14■■■□□ 2.25
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 GRIN2AQ12879 1464 aa29.05■■■□□ 2.24
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.01■■■□□ 2.23
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ADAMTS12P58397 1594 aa28.97■■■□□ 2.23
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 CEP170Q5SW79 1584 aa28.97■■■□□ 2.23
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 NUP160Q12769 1436 aa28.96■■■□□ 2.23
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 SHROOM2Q13796 1616 aa28.9■■■□□ 2.22
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.86■■■□□ 2.21
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.79■■■□□ 2.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.78■■■□□ 2.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.77■■■□□ 2.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 TOP2BQ02880 1626 aa28.76■■■□□ 2.2
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 JPH4Q96JJ6 628 aa28.64■■■□□ 2.18
THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.6■■■□□ 2.17
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