Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRPRBQ9Y5M8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRPRBQ9Y5M8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRPRBQ9Y5M8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRPRBQ9Y5M8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms