Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3HQ9Y535 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3HQ9Y535 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3HQ9Y535 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3HQ9Y535 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms