Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms