Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRAPPC8Q9Y2L5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
TRAPPC8Q9Y2L5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TRAPPC8Q9Y2L5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TRAPPC8Q9Y2L5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TRAPPC8Q9Y2L5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TRAPPC8Q9Y2L5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRAPPC8Q9Y2L5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRAPPC8Q9Y2L5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRAPPC8Q9Y2L5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
TRAPPC8Q9Y2L5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
TRAPPC8Q9Y2L5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
TRAPPC8Q9Y2L5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms