Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM50BQ9Y247 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM50BQ9Y247 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM50BQ9Y247 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FAM50BQ9Y247 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms