Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDV3Q9UKY7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDV3Q9UKY7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDV3Q9UKY7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDV3Q9UKY7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms