Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
MLH3Q9UHC1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
MLH3Q9UHC1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
MLH3Q9UHC1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
MLH3Q9UHC1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
MLH3Q9UHC1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
MLH3Q9UHC1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
MLH3Q9UHC1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
MLH3Q9UHC1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
MLH3Q9UHC1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
MLH3Q9UHC1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
MLH3Q9UHC1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
MLH3Q9UHC1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
MLH3Q9UHC1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
MLH3Q9UHC1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
MLH3Q9UHC1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.59■■■■□ 3.77
MLH3Q9UHC1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
MLH3Q9UHC1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
MLH3Q9UHC1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
MLH3Q9UHC1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
MLH3Q9UHC1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
MLH3Q9UHC1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
MLH3Q9UHC1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms