Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUX4Q9UBX2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4Q9UBX2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUX4Q9UBX2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms