Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCC2Q9P258 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCC2Q9P258 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCC2Q9P258 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCC2Q9P258 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCC2Q9P258 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCC2Q9P258 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RCC2Q9P258 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RCC2Q9P258 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCC2Q9P258 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCC2Q9P258 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCC2Q9P258 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCC2Q9P258 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCC2Q9P258 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCC2Q9P258 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RCC2Q9P258 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCC2Q9P258 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RCC2Q9P258 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RCC2Q9P258 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RCC2Q9P258 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RCC2Q9P258 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCC2Q9P258 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RCC2Q9P258 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RCC2Q9P258 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RCC2Q9P258 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCC2Q9P258 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCC2Q9P258 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCC2Q9P258 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RCC2Q9P258 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCC2Q9P258 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCC2Q9P258 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCC2Q9P258 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RCC2Q9P258 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCC2Q9P258 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RCC2Q9P258 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCC2Q9P258 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCC2Q9P258 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCC2Q9P258 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms