Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED29Q9NX70 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED29Q9NX70 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MED29Q9NX70 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED29Q9NX70 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED29Q9NX70 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms