Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX7

KBTBD4, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD4Q9NVX7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KBTBD4Q9NVX7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KBTBD4Q9NVX7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KBTBD4Q9NVX7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KBTBD4Q9NVX7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KBTBD4Q9NVX7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
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