Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO6Q9NRD1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO6Q9NRD1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO6Q9NRD1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO6Q9NRD1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms