Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC134Q9H6E4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC134Q9H6E4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC134Q9H6E4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC134Q9H6E4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC134Q9H6E4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC134Q9H6E4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC134Q9H6E4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC134Q9H6E4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC134Q9H6E4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC134Q9H6E4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC134Q9H6E4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC134Q9H6E4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms