Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2DQ9H6A0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND2DQ9H6A0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2DQ9H6A0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENND2DQ9H6A0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2DQ9H6A0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms