Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STN1Q9H668 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STN1Q9H668 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STN1Q9H668 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms