Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRDQ9H2X0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRDQ9H2X0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRDQ9H2X0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRDQ9H2X0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRDQ9H2X0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRDQ9H2X0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRDQ9H2X0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRDQ9H2X0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRDQ9H2X0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRDQ9H2X0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms