Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC2Q9BYS8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC2Q9BYS8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRC2Q9BYS8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC2Q9BYS8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC2Q9BYS8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms