Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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KRTAP9-2Q9BYQ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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KRTAP9-2Q9BYQ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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KRTAP9-2Q9BYQ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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KRTAP9-2Q9BYQ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP9-2Q9BYQ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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KRTAP9-2Q9BYQ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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KRTAP9-2Q9BYQ4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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KRTAP9-2Q9BYQ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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KRTAP9-2Q9BYQ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP9-2Q9BYQ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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