Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTRT3Q9BYD9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTRT3Q9BYD9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTRT3Q9BYD9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms