Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP4Q9BWG4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSBP4Q9BWG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSBP4Q9BWG4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms