Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM106CQ9BVX2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM106CQ9BVX2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM106CQ9BVX2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM106CQ9BVX2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM106CQ9BVX2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms