Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM246Q9BRR3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM246Q9BRR3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM246Q9BRR3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM246Q9BRR3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms