Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAT1Q99536 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAT1Q99536 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VAT1Q99536 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VAT1Q99536 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAT1Q99536 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms