Protein–RNA interactions for Protein: Q99436

PSMB7, Proteasome subunit beta type-7, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB7Q99436 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMB7Q99436 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMB7Q99436 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSMB7Q99436 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMB7Q99436 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSMB7Q99436 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMB7Q99436 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms