Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UHRF1Q96T88 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UHRF1Q96T88 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UHRF1Q96T88 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UHRF1Q96T88 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms