Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ALS2Q96Q42 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ALS2Q96Q42 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ALS2Q96Q42 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ALS2Q96Q42 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ALS2Q96Q42 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ALS2Q96Q42 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ALS2Q96Q42 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ALS2Q96Q42 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ALS2Q96Q42 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ALS2Q96Q42 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ALS2Q96Q42 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ALS2Q96Q42 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ALS2Q96Q42 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
ALS2Q96Q42 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ALS2Q96Q42 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ALS2Q96Q42 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ALS2Q96Q42 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms