Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM8Q96KF7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM8Q96KF7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM8Q96KF7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM8Q96KF7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM8Q96KF7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM8Q96KF7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM8Q96KF7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM8Q96KF7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SMIM8Q96KF7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM8Q96KF7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM8Q96KF7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM8Q96KF7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms