Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
LRRIQ1Q96JM4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
LRRIQ1Q96JM4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
LRRIQ1Q96JM4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
LRRIQ1Q96JM4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
LRRIQ1Q96JM4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
LRRIQ1Q96JM4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
LRRIQ1Q96JM4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
LRRIQ1Q96JM4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
LRRIQ1Q96JM4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
LRRIQ1Q96JM4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
LRRIQ1Q96JM4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
LRRIQ1Q96JM4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
LRRIQ1Q96JM4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
LRRIQ1Q96JM4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
LRRIQ1Q96JM4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
LRRIQ1Q96JM4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
LRRIQ1Q96JM4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
LRRIQ1Q96JM4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
LRRIQ1Q96JM4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
LRRIQ1Q96JM4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
LRRIQ1Q96JM4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
LRRIQ1Q96JM4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
LRRIQ1Q96JM4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
LRRIQ1Q96JM4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
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