Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNF8Q96H20 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNF8Q96H20 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNF8Q96H20 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms