Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAMBPL1Q96FJ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STAMBPL1Q96FJ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
STAMBPL1Q96FJ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STAMBPL1Q96FJ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
STAMBPL1Q96FJ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
STAMBPL1Q96FJ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAMBPL1Q96FJ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
STAMBPL1Q96FJ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STAMBPL1Q96FJ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STAMBPL1Q96FJ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms