Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1E2Q96A05 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP6V1E2Q96A05 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP6V1E2Q96A05 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms