Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EXT2Q93063 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXT2Q93063 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXT2Q93063 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXT2Q93063 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms