Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PRG4Q92954 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
PRG4Q92954 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.46■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
PRG4Q92954 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
PRG4Q92954 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
PRG4Q92954 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PRG4Q92954 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.26■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
PRG4Q92954 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PRG4Q92954 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms