Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
TOPBP1Q92547 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
TOPBP1Q92547 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC43.77■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
TOPBP1Q92547 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC43.73■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
TOPBP1Q92547 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC43.63■■■■■ 4.58
TOPBP1Q92547 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
TOPBP1Q92547 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
TOPBP1Q92547 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
TOPBP1Q92547 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
TOPBP1Q92547 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
TOPBP1Q92547 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
TOPBP1Q92547 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
TOPBP1Q92547 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
TOPBP1Q92547 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
TOPBP1Q92547 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
TOPBP1Q92547 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
TOPBP1Q92547 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
TOPBP1Q92547 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms