Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHC3Q92529 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHC3Q92529 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHC3Q92529 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHC3Q92529 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHC3Q92529 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHC3Q92529 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHC3Q92529 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHC3Q92529 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SHC3Q92529 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHC3Q92529 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHC3Q92529 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC3Q92529 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC3Q92529 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHC3Q92529 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms