Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATL1Q8WXF7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL1Q8WXF7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATL1Q8WXF7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms