Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF12Q8WXF0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF12Q8WXF0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF12Q8WXF0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF12Q8WXF0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF12Q8WXF0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF12Q8WXF0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF12Q8WXF0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF12Q8WXF0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF12Q8WXF0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms